Биоинформатика для каждого или как биоинформатика и открытые генетические данные могут стимулировать развитие науки в развивающихся странах - этому посвящена статья Мангула и Тома.

Исследователи из Калифорнийского университета Лос Анжелеса ( UCLA) и Университета Джорджа Вашингтона (GWU) призывают к расширению международного участия в исследованиях в области биомедицинских и биологических наук. В статье, опубликованной 4 марта 2019 года в журнале Nature Biotechnology, Сергей Мангул, доктор наук и исследователь Калифорнийского университета в Лос Анжелесе, выходец из Молдовы, совместно с Яном Тома,  профессором и заместителем директора по геномным клиническим исследованиям, Университет Джорджа Вашингтона, выходец из Молдовы, предлагают новую образовательную платформу, которая, будучи внедренной в куррикулум медицинского образования, позволит подготовить специалистов  в области биоинформатики международного уровня, способных на ранних сроках диагностировать и лечить такие заболевания как грипп, рак, сердечные заболевания и диабет.

Сергей: "Биоинформатика —  это довольно новая междисциплинарная область. Она находится на стыке компьютерной науки, статистики, математики и биологии и позволяет  анализировать и применять масштабные биологических данные для решения проблем в области биологии и медицины. Проводятся исследования по выявлению генетических изменений у пациентов, что позволяет ученым предлагать лучшие методы лечения и даже возможные меры профилактики. Например, определенные типы рака, вызванные такими генетическими изменениями, могут быть идентифицированы заранее и лечение может начаться до ухудшения состояния."

Все крупные медицинские и фармацевтические компании Запада сегодня стремятся нанять профессионалов, имеющих опыт в области биоинформатики, для работы с огромным количеством биологической и медицинской информации и  разработки лучших решения для ранней диагностики заболеваний и мер по их профилактике и предотвращении. Стереотипно считается, что такого рода анализы требуют специальных ресурсов и знаний и доступны только в развитых странах Запада.

"Наша образовательная платформа, - говорит Сергей, - доказывает, что сегодняшняя доступность компьютерных ресурсов и открытых “больших” данных (включая генетические) позволяет ученому из любой страны с  доступом к компьютерным ресурсам выполнять вычислительный анализ биоинформатических данных. Мы призываем к образованию в области биоинформатики во всех странах вне зависимости от уровня развития и создаем глобальный консорциум по обучению и поддержке в области биоинформатики, который объединяет существующие платформы и материалы, чтобы стимулировать ученых из развивающихся стран участвовать в передовых исследованиях."

Так, Хавьер Э. Санчес-Галан, соавтор статьи, исследователь и профессор в Технологическом университете Панамы, отмечает, что большинство крупных учебных заведений в Центральной Америке уже обладают адекватной вычислительной инфраструктурой для выполнения аналитической работы. Получив специализированное обучение и облачные вычислительные ресурсы, студенты и

Исследователи в Центральной Америке могли бы разрабатывать методы и приобретать знания, чтобы модернизировать отечественные академические единицы, как это сделали многие небольшие институты в Соединенных Штатах за последнее десятилетие.

"Я верю, - говорит Сергей, - что в Молдове на основе существующей образовательной и технической базы тоже можно развить специалистов в области биоинформатике и вовлекать их в исследования мирового масштаба, модернизировать существующие методы диагностики и лечения, что значительно улучшит уровень медицины и здравоохранения в стране,  от лечения индивидуальных пациентов до исцеления всех групп населения."

Как часть этой образовательной инициативы, доктор Мангул будет проводить семинары по биоинформатике в Государственном университете медицины и фармакологии имени Николая Тестемицану. Курс покроет основы биоинформатики, включая высокопроизводительные вычисления с помощью командной строки.

Для получения дополнительной информации о научное статье и о предлагаемой модели можно связаться с Сергеем Мангулом по электронной почте smangul@ucla.edu.

фото обложки: upibi.org/bioinformatics-core

Запись Статью учёных выходцев из Молдовы о биоинформатике и генетических данных опубликовали самые престижные научные журналы мира впервые появилась Locals.